K5622 Sutter instrument P-2000/F laser puller protocol Nano capillary column을 만드는데 있어서 이전에 사용하던 프로그램이 새 장비에 적절치 않다는것을 알게 되었습니다. 아마 laser의 강도가 다르기 때문일듯합니다. 이것저것 해보다가 혹시나 하고 업체에 연락을 하니 Protocol을 보내주었네요. 먼저 이 방법대로 시작해서 추가적으로 최적화 하면 될듯합니다. 2022. 5. 27. DIA experiments with noFAIMS vs FAIMS? 이전글에 FAIMS를 이용한 DIA 분석에 대해서 간단히 설명하였습니다. 언급했듯이 FAIMS를 이용한 DIA에서는 각 CV값별로 분석시간이 요구됨으로 Cycle time 관점에서 보면 단점이 있습니다. 하지만 반대로 complexity를 줄여서 감도를 향상시키는 장점이 있습니다. 둘 중에 효과가 큰것에 따라 장점이 될수 있고 단점이 될수 있을 듯합니다. 앞으로의 DIA분석에서 FAIMS를 사용해도 될지 결정하기 위해서 간단히 비교실험을 해보았습니다. Promega사의 K562 를 tryptic digestion후 2ug을 각각 3번 주입하였습니다. No FAIMS와 FAIMS에서의 질량분석기 파라미터는 기존의 실험에서 최적화한것을 각각 사용하였습니다. 모두 8 data-points 이상을 가지는 조건으.. 2022. 5. 27. 이전 1 다음
