분류 전체보기563 Northestern May Institute 웍샵 https://computationalproteomics.khoury.northeastern.edu/보스턴에 있는 Northeastern University의 May Institute에서 주최한 워크샵에 참석하였습니다.이번 워크샵에서는 하루 과정의 FragPipe 과정과 이틀 과정의 Python 과정을 신청했습니다.FragPipe 과정FragPipe는 현재 제가 주로 사용하는 프로그램은 아닙니다. 하지만 Proteome Discoverer나 Spectronaut에서 검색이 잘 되지 않는 경우, FragPipe를 추가적인 분석 도구로 활용할 수 있을 것 같아 관심을 가지고 있었습니다.FragPipe의 장점은 다양한 application을 지원한다는 점입니다. 특히 Proteome Discoverer나 Sp.. 2026. 5. 19. Simple Link를 EasySpray source에 연결할때 주의점 Spray tip 을 Simple Link에 연결한후 EasySpray source에 장착하는 과정에서 몇개 망가뜨렸습니다. EasySpray source에 삽입하는 과정에서 tip 끝이 EasySpray source 안쪽의 벽에 닿아서 부러집니다. Source 안쪽을 보면 중간에 작은 구멍이 있습니다. 이 공간 안에 tip이 정확히 들어가야 됩니다. 하지만 끼우는 과정에서 tip 끝이 흔들리게 되면 벽에 부딪혀서 부서지게 됩니다. Tip을 Simple Link에 장착할 때 tip 끝이 가능한 한 짧게 나오게 합니다. 그러면 tip이 흔들리지 않고 중앙에 고정됩니다. 이렇게 짧게 장착하면 Ion transfer tube와 거리가 멀어지게 됩니다. 이 경우 일단 장착한 후 tip이 안전하게 밖으.. 2026. 5. 2. PRM에서 tagert peptide 의 최적 FAIMS CV값 찾기 개인적으로 FAIMS의 장점을 최대한 활용하려고 합니다. 물론 단점도 있습니다. 한 번의 분석에서 사용할 수 있는 CV 값의 수가 제한적이고, CV 값이 바뀔 때 걸리는 시간(아주 짧은 시간이지만)도 감도에 영향을 줄 수 있습니다. PRM 분석에서는 조금 더 까다롭습니다.검출하려는 펩타이드가 어느 CV 값에서 가장 잘 검출되는지 하나씩 확인해야 합니다. 타깃 펩타이드 수가 많아질수록 이 과정은 더 번거로워집니다. 가장 간단한 방법은 서로 다른 CV 값을 사용하여 Full Scan을 수행하고, MS1 peak intensity를 비교하는 것입니다. 각 CV 값마다 method를 따로 만들 수도 있지만, 작업이 번거롭고 시간도 많이 소요됩니다. 그래서 하나의 method 안에 여러 CV 값을 넣어서 확인하는.. 2026. 4. 25. 냉정한 이타주의자 (doing good better)-윌리엄 맥어스킬 좋은 의도만으로는 충분하지 않고, 실제로 가장 큰 도움을 주는 방법을 따져서 행동해야 한다. 남을 돕고 싶다면 감정이나 직감만 따르지 말고, 데이터와 근거를 바탕으로 가장 많은 선을 만들어내는 방법을 선택하자는 내용입니다. 즉, 같은 돈·시간·노력이라도 어디에 쓰느냐에 따라 선한 영향력의 크기가 크게 달라진다는 점을 강조합니다. 사람들을 도와주는 일, 예를 들면 기부할 때 기부를 하는 것에 만족감으로 그치지 말고 실제 기부한 돈이 효과적으로 사용되고 있는지 아는 것도 중요하다고 합니다. 많은 사례를 통해서 우리의 도움이 실제 목적하는 바에 미치지 못하는 경우가 많다는 것을 보여줍니다. 저자의 탁월한 논리와 예시를 통해 새롭게 알게 된 점들이 있습니다. 하지만 저 같은 개인이 일일이 이러한 일을 알아.. 2026. 4. 23. 회복탄력성 -김주환 인생을 살아간다는 것은 쉽지 않은 것 같습니다. 누구나 큰 어려움을 한두 번은 겪게 되지요 . 그것이 외부에서 오든 내부에서 오든, 어려움은 사람을 정신적으로 힘들게 합니다. 회복탄력성이 높은 사람은 여러 방면에서 다가오는 시련을 긍정적으로 잘 견디고 이겨냅니다. 우리의 태도에 따라서 어려움을 이겨낼 수도 있기도 하고 그렇지 않기도 한 것 같습니다. 삶에 대한 긍정적인 태도와 어려운 상황을 이겨내고 극복하는 능력이 필요한 것 같습니다. 어려운 상황이 생길 때 회복탄력성을 생각하며 이겨내기나의 강점에 집중하고 이 강점을 통해 행복을 찾기 2026. 4. 23. EasySpray Emitter 대체용 ( fossiliontech ) Thermo 장비를 사용하는 경우, EasySpray source는 사실상 표준처럼 사용됩니다.특히 µPAC column을 사용할 때는 Spray tip(Emitter)이 필수이기 때문에 대부분 EasySpray emitter를 함께 사용하게 됩니다.EasySpray source에 맞게 제작이 되었기 때문에 사용하기가 편리합니다.https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/ES993실제로 예전에 일반 spray tip을 연결해서 사용해 본 적이 있는데, 설치 과정이 까다롭고 tip이 쉽게 손상되는 문제가 있었습니다. 이후로는 계속 EasySpray emitter를 사용해 왔습니다. 최근 들어 EasySpray emitter 가격이 많이 상승했습니다. 현재.. 2026. 4. 20. 이전 1 2 3 4 ··· 94 다음
