Proteomics (프로테오믹스, 단백체학)
본문 바로가기

전체 글588

스토아적 삶의 권유 -마르코스 바스케스 철학이 없는 삶은 아무 생각 없이 사는 것과 같다. 우리를 이끌어줄 마음속 나침반이 없다면, 우리는 많은 사람이 가는 길을 아무 생각 없이 따라갈 것이다. 우리에게 해를 끼치는 것은 우리에게 일어나는 일이 아니라,그 일에 대한 우리의 생각이다 머릿속에 맴돌지만 문장으로 표현하지 못하는 생각들이 있다. 이러한 생각을 정리해 주는 문장을 책에서 만나서 참 반갑다. 마치 찾지 못했던 숨은 그림의 정답을 본 기분이다. 이 문장들이 나에게 그러하다. 정리되지 않는 고민, 내려야 할 결정들... 하루에도 여러 번 바뀌는 생각들이 있다. 그러면 결국 다른 사람들의 말에 귀가 솔깃해진다.철학은 다른 사람들의 말에 휘둘리지 않고 내가 정해 놓은 삶의 방향대로 가기 위해 필요한 것이다. 한국에 오는 비행기에서 전자책으.. 2026. 9. 27.
멘탈의 연금술-보도쉐퍼, 위대한 12주 브라이언 P. 모런 얼마 전에 읽은 두 권의 책과는 결이 다른 책입니다 『멘탈의 연금술』을 "이기는 습관", "보도 셰퍼의 돈"의 저자인 보도 셰퍼의 또 다른 책입니다. 이 책은 원하는 목표를 이루기 위해서는 능력보다 어려움을 견디고 다시 일어서는 정신력이 중요하다고 말하는 책입니다. 저자가 말하는 강한 멘탈은 실패하지 않는 마음이 아닙니다. 실패와 두려움을 경험하면서도 그 자리에 머물지 않고 다시 행동하는 힘입니다. 문제를 피하기보다 해결할 방법을 찾고, 작은 성취를 반복하면서 자신에 대한 믿음을 키워야 합니다. 『 위대한 12주 』는 1년 단위 계획이 실패하기 쉬운 이유를 설명하고, 12주 계획으로 설계할 것을 강조합니다. 사실 연초에 계획을 세우고 1~2개월 동안 별로 진전이 없어도 크게 개의치 않습니다. 바.. 2026. 9. 13.
나를 소모하지 않는 현명한 태도에 관하여- 마티아스 뇔케 얼마 전 읽은 책, '쓸모를 증명하지 않는 삶에 관하여'와 비슷한 맥락의 내용입니다. 자신을 적극적으로 드러내야 하는 시대에 살고 있습니다. 그래서 내가 무엇을 이루었는지 알리고, 다른 사람보다 더 능력 있고 행복한 사람처럼 보여야 인정받을 수 있다고 생각하기도 합니다. 하지만 이렇게 끊임없이 자신을 증명하려다 보면 마음이 쉽게 지칩니다. 다른 사람의 반응에 예민해지고, 인정받지 못하면 자신의 가치까지 의심하게 됩니다. 마티아스 뇔케의 『나를 소모하지 않는 현명한 태도에 관하여』는 이런 시대의 흐름과 조금 다른 삶의 방식을 이야기합니다. 나의 가치를 증명하기 위해 모든 에너지를 사용하지 않아도 됩니다. 특히 저자는 겸손을 강조합니다. 현대 사회에서 겸손의 자세로 인해 인정받을 수 있는 일도 인정받지.. 2026. 9. 13.
질량분석을 하기 전에 왜 단백질을 펩타이드로 자를까? 프로테오믹스를 처음 접하면 한 가지 의문이 생길 수 있습니다.“단백질을 분석하려는 것인데, 왜 굳이 단백질을 잘게 잘라 더 많은 펩타이드로 만든 다음 분석할까?” Western blot을 비롯한 많은 생물학 실험은 단백질 수준에서 진행됩니다. 따라서 단백질을 먼저 펩타이드로 절단하는 과정이 오히려 불필요하게 복잡해 보일 수 있습니다. 질량분석기 기반 프로테오믹스에는 크게 두 가지 분석 방법이 있습니다. 단백질을 효소로 절단하여 펩타이드 상태로 분석하는 방법을 bottom-up proteomics라고 하며, 단백질을 절단하지 않고 온전한 상태로 분석하는 방법을 top-down proteomics라고 합니다. 현재 복잡한 생물학적 시료를 폭넓게 분석할 때는 bottom-up proteomics가 가장 일반.. 2026. 9. 7.
프로테오믹스 분석 플랫폼 구축 및 최적화 질량분석기 기반 프로테오믹스 분석 플랫폼을 구축하기 위해서는 여러 핵심 단계가 안정적으로 정립되어야 합니다. 대표적으로 시료 전처리 최적화, LC 분리 조건 최적화, 질량분석기 조건 최적화, 데이터베이스 검색 및 결과 검증 최적화가 포함됩니다. 이 단계들은 각각 독립적으로 보이지만 실제 분석 과정에서는 서로 밀접하게 연결되어 있습니다. 예를 들어 시료 전처리 과정에서의 단백질 추출 효율이나 펩타이드 정제 상태는 LC 분리와 질량분석 감도에 직접적인 영향을 미치며, 질량분석 조건은 이후 데이터베이스 검색 결과와 정량 신뢰도에 영향을 줍니다. 따라서 각 단계를 개별적으로 최적화하는 동시에, 전체 워크플로우가 실험 목적에 맞게 균형 있게 작동하도록 조정하는 것이 중요합니다. 본 자문은 연구팀이 보유한 장비, .. 2026. 9. 2.
자문의 목적 본 자문은 질량분석기를 활용한 프로테오믹스 연구를 시작하거나, 현재 보유한 장비와 리소스를 더 효과적으로 활용하고자 하는 연구팀을 돕기 위한 것입니다. 특히 이미 안정적인 분석 플랫폼을 갖춘 그룹보다는, 초기 플랫폼 구축이 필요하거나 기존 분석법의 최적화 여부를 확인하고 싶은 그룹을 주요 대상으로 합니다. 프로테오믹스 분석에 대한 논문, 매뉴얼, 인터넷 자료는 많이 존재하지만, 실제 연구 현장에 그대로 적용하기는 쉽지 않습니다. 각 연구팀마다 보유한 질량분석기, LC 시스템, 컬럼, 시료 준비 장비, 분석 소프트웨어, 인력, 예산, 시료 특성이 다르기 때문입니다. 따라서 공개된 방법을 참고하더라도, 각 실험실의 상황에 맞게 조정하고 최적화하는 과정이 필요합니다. 프로테오믹스 분석은 시료 전처리, 시료 정.. 2026. 9. 2.