Proteomics (프로테오믹스, 단백체학)
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Orbitrap Astral, 7417 Proteins (7min, 200ng HeLa) Thermo Fisher사에게 Astral의 raw files을 요청한 후 몇가지 파일을 받았습니다. 보통 슬라이드에 있는 내용은 회사에 유리하도록 만들어진 경우가 많습니다. 그래서 실제 raw file을 분석해보는게 좋을것 같았습니다. 결과는.....놀랍습니다. 200ngHeLa standard를 7분안에 7,000이상의 단백질을 검출했습니다. 약 0.6 sec동안 117 MS/MS가 이루어졌고 마지막 MS/MS 스펙트럼도 아주 좋습니다. Maxium Injection time도 3ms 입니다. Orbitrap Eclise와 Exploris 480을 몇개월동안 최적화를 했는데... Orbitrap Astral은 그냥 7분안에 간단히 끝내버렸네요 2024. 3. 7.
2023 Omics Collateral (Thermo Fisher) 좋은 자료들이 많이 있네요 2024. 3. 4.
Orbitrap Astral $999,500.00 아주 좋은 가격에 나왔네요. Exploris 480 가격과 차이가 거의 없습니다. 어서 주문하세요!! 아마 직원이 숫자하나를 빼먹은듯하네요 :) 2024. 2. 27.
PreOmics Plasma and Serum Enrichment Kit (Enrich-iST)-Human 한국에 있을띠 Plasma 을 이용한 실험을 꽤 오랫동안 했었습니다. Human Plasma Proteome Project에도 참여하기도 하였습니다. 이전에 Agilent 의 MARS 컬럼도 저희 팀에 Prototype 을 사용하여 본사측에 데이타를 주곤했습니다. 오랫동안 Antibody를 이용한 high abundant depletion이 상당히 유행했지만 어느순간 잘 사용하지 않습니다. 많은 문제점들이 발견되었기 때문이지요. 최근에는 Antibody가 아닌 방법으로 Enrichment 하는 기술들이 소개되고 있습니다.. 또한 질량분석기의 감도가 발전하면서 High-abundant proteins이 존재하더라도 많은 low abundant protein을 검출할수있습니다. 차후 Plasma 연구를 위한.. 2024. 2. 26.
돈의 역사 -홍준욱- 이코노미스트 홍춘욱 박사님이 쓴 돈에 관한 이야기입니다. 세계사의 주요 사건들의 이면에 존재하는 돈의 역사를 이야기해줍니다. 쉬운 내용이라 생각했는데 역사과 경제용어등을 조금은 알아야 더 쉽게 이해되는 책입니다. 우리가 일상적으로 쓰는 돈은 여러 역사에 얽혀서 이루진 산물입니다. 전쟁이 없었다면 아마 지금쓰는 돈의 개념이 아주 달려졌겠지요. 돈의 역사를 알게 되면 돈의 속성이 무엇인지 알게 되는것 같습니다. 돈의 속성을 알아야 돈을 어떻게 벌고 어떻게 써야 되는지도 알게 될것 같습니다. . 읽고 나서 개인적으로 크게 실천해야할 내용은 발견하지 못했습니다. 하지만 돈은 어릴적 배운 단순히 물물교환 수단만이 아니라 우리의 역사와 디엉켜저서 생긴 것임을 배우게 되었습니다. 2024. 2. 26.
9K protein Quantitation of Human iPSC Cells with a single DIA shot Single Shot DIA로 Human iPSC에서 약 9,000개 이상의 단백질을 정량분석하였습니다. 최근 2년동안 분석한 시료에서 가장 많은 숫자가 검출이 된것 같습니다. Orbitrap Eclipse FAIMS Vanquish NeO CoAnn Column (1.7um, 20cm) 2024. 2. 18.