전체 글519 Top-Down Proteomics Top-down proteomics 를 시작해볼까 구상중입니다. Bottom-up Proteomics처럼 Complex 시료는 분석할수 없겠지만 몇개의 정제된 단백질의 경우 Top-Down Proteomics로 분석할수 있을듯합니다. 연구소에서도 요청이 들어오고 있습니다. 10월에 시카고에서 열렸던 Top-Down Proteomics Workshop을 다녀온후 조금씩 시도를 해보고 있습니다. 아래 프로토콜 처음시작하는 사람들에게 아주 좋은것 같습니다. Self-packing PLRP-S Column and NRTDP Standards 프로토콜에 나온 PLRP-S resin Agilent에서 구매한후 Self-packing 컬럼을 만들었습니다. Standard 시료도 논문에 있는것과 같이 준비하였습니다. .. 2023. 10. 28. Skybridge, Michigan (주말 단풍구경) 2023. 10. 23. Proteome Discoverer 3.1 and CHIMERYS 2.0 (Phosphopeptides) 이번에 Proteome Discoverer(PD)3.1과 CHIMERYS 2.0이 같이 출시가 되었습니다. PD의 경우 3.0과 3.1을 비교하면 아직까지 특별히 큰 차이점은 없는것 같습니다. 하지만 CHIMERYS 2.0이 PD 3.1과 연동되어 좋은 성능을 보입니다. CHIMERYS 1.0에서는 PTM 옵션이 제한적이 었습니다. 하지만 CHIMERYS 2.0에서는 phosphorylation ( S,T,Y)분석이 가능합니다. 동일한 한개의 파일을 이용해서 PD3.0과 PD3.1로 분석한 Phosphopeptide 분석 결과입니다. 기존의 비해서 약 50%가 증가하였습니다. 2023. 10. 14. 110 cm µPAC Neo Column 저번의 Low Load µPAC Neo Column을 테스트한후 이번에는 110 cm µPAC Neo Column 을 테스트해보았습니다. 현재 사용하는 있는 컬럼은 CoAnn Technology사의 pre-packed column입니다 (1.7 µm C18, 75 µ m x 20cm). 아주 만족하고 사용하고 있지만 분석방법을 더 향상 시킬수 있는 방법이 없나 생각중에 있습니다. 1.7 µm C18임으로 시스템에 압력이 상당히 많이 걸립니다. 그래서 컬럼이 길이를 더 길게 할수는 없습니다. 물론 가능하겠지만 장비에 큰 압력이 가해진 상태로 오랜 실험을 하는것이 좋은 생각은 아닌것 같습니다. 또한 1.7 µm C18이라서 지저분한 시료를 많이 주입하면 컬럼이 쉽게 막혀버립니다. 아주 많은 시료를 정량분석을.. 2023. 10. 2. Proteome Discoverer 3.1 workshop records Thermo Fisher Download and Licensing : Login (flexnetoperations.com) Log in - other releases- PD 3.1 Proteome Discoverer Training Workshop 2023. 9. 20. Orbitrap Astral (2023 ASMS Vendor seminar) 저번주에 Thermo fisher 장비판매를 담당하는 몇분이 연구소를 방문하여 최신장비에 대해서 이야기를 했습니다. 대부분 Orbitrap Astral 에 대한 이야기였습니다. 사실 업체측에서 제공하는 결과가 본인의 실험에도 동일하게 나온다는 보장은 전혀없습니다. 그래서 실제 실험실에서 얻은 결과를 보기 전까지는 일단 완전히 신뢰를 하지 않는 편입니다. 하지만 일단 업체측에서 보여준 결과는 아주 좋습니다. 슬라이드에 나온 결과의 약 80%정도만 실제 실험실에서 얻을수 있다면 아주 좋을듯합니다. 최근 Orbitrap Astral에 좋은 결과들 나오고 있고 놀라고 있습니다. 반면 다들 높은 가격으로도 인해 놀라고 있습니다. Orbitrap Astral 1대의 가격으로 3대의 Exploris480을 사는것이 .. 2023. 9. 20. 이전 1 ··· 3 4 5 6 7 8 9 ··· 87 다음
