Proteomics (프로테오믹스, 단백체학)
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EasyPep™ MS Sample Prep Kits로 1E3~1E6 Cells Analysis 현재 여기서 일하는곳의 좋은 점은 분석에 대한 범위를 우리가 정할수 있다는것입니다. 그렇지 않으면 다양한 분석에 대해 일일히 분석조건을 맞추어야 합니다. Cell lysates 의 경우 Thermo Fisher사의 Thermo Scientific™ EasyPep™ MS Sample Prep Kits 를 사용합니다. 그리고 안전한 시료의 양이 1E6 cells 이상만을 요청합니다. 실제로 2ug정도 밖에 주입을 하지 않지만 충분한 수의 세포를 사용하게 되면 모든 과정이 순조롭습니다. 적화된 전처리 방법을 루틴하게 사용할수 있도록 고정된 시료의 양을 요청하는것이 저희 입장에서는 좋습니다. 하지만 부득이 시료의 양이 적을때를 위해서 몇가지를 테스트 해보았습니다. 서로 다른 HEK293 cell 수 (1E6, .. 2024. 2. 4.
습관의 힘 -찰스 두히그- 아주 유명한 책이지요. 자기개발에 관심 있으신분은 아마 한번쯤 읽어보거나 들어보았을껍니다. 저도 이번이 두 번째 읽습니다. 습관에 대해 새로운 관점을 갖게 해준 책입니다. 다시 읽는것인데도 새롭게 느껴지네요. 첫번재 읽을 때는 습관에 대해 새로운 접근법이 너무 재미있었습니다. 습관을 해석 하기 위한 여러가지 실험내용이 재미가 있었습니다. Γ 과학자들의 연구에 따르면 습관이 형성되는 이유는 우리 뇌가 활동을 절약할 방법을 끊임없이 찾기 때문이다. 어떤 자극도 주지 않고 가만히 내버려 두면 뇌는 일상적으로 반복되는 거의 모든 일을 무차별적으로 습관으로 전환시키려고 할 것이다. 습관이 뇌에게 휴식할 시간을 주기 때문이다.뇌가 활동을 절약하려는 본능은 우리에게 상당히 유리하게 작용한다. 뇌가 효율적이면 그만큼 .. 2024. 1. 12.
C.elegans Phosphopeptide Analysis with FAIMS/GL-Science TiO2 beads/PD3.1+CHIMERYS 많은 논문에서 많은 수의 Phosphopeptide를 검출한 실험을 보면 신기하였습니다. Enrichment하는 방법이 특별히 어려운것이 없었기 때문입니다. 하지만 직접실험을 하면 그 만큼의 숫자를 볼수 없었습니다. 이제는 질량분석기의 감도와 더불어 검색툴이 좋아져서 일반사람들도 (?) 많은 수의 Phosphopeptide 를 검출할수 있습니다 앞의 실험에서는 최근의 많이 사용되고 있는 ReSyn Biosciences 사의 Ti-IMAC Magnetic beads 를 사용하였습니다.C.elegans and Mouse Brain Phosphopeptides (over 26,000 phosphopeptides) (tistory.com) 더 많은 phosphopeptide spectra를 얻기위해서 다른 Ch.. 2024. 1. 2.
혼자가 편한 사람들의 관계심리학, 데보라 잭 지음 우리 사회는 외향적인 사람이 칭송을 받습니다. 사람들과의 대화를 잘 주도하고 모든일을 앞서서 잘 하는사람을 좋아합니다. 예전에는 저는 외향적이라고 생각했습니다. 그것은 사람들 만나는것을 좋아하거나 대화를 잘해서가 아닙니다. 혼자 있는것이 어색했기 때문일것이라 생각합니다. 사실 쓸데 없는 농담도 많이 했습니다. 하지만 지금은 오히려 혼자 있는 시간에 더 많은 에너지를 얻습니다. 그렇다고 이 책에서 설명하는 내향적인 사람들이 가지고 있는 특성을 그다지 많이 가지고 있는것 같지는 않습니다. 아마 자라오면서 나의 삶에 형태에 최적화된 삶을 패턴을 가지게 된것 같습니다. 농담을 많이 했던것도 아마 속마음을 이야기하는것이 어려워서 그렇게 했겠지요. 혼자 있는 시간이 그다지 즐겁지 않았던 이유도 나를 돌아보는것이 어.. 2023. 12. 31.
C.elegans and Mouse Brain Phosphopeptides (over 26,000 phosphopeptides) 크리스마스 전부터 여기는 이미 장기간 연휴에 돌입했습니다. 연구원들에게도 크리스마스전부터 연말까지는 될수 있으면 실험은 하지말고 밀린 자료들등을 정리하는 시간을 갖자고 했습니다.. 하지만 장비가 노는 꼴을 잘 못보는 타입이라 긴 여유동안 Phosphopeptide 분석을 했습니다. 내년에 Global Phosphproteome Quantitation 분석을 제공할 예정입니다. Mouse Brain과 C.elegans에서 Phopshopeptide를 Enrichment한뒤 FAIMS의 서로 다른 CV값에서 DDA로 분석하였습니다. 30V에서 80CV까지 11개의 서로 다른 값으로 분석하였습니다. 그리고 남는 시료는 FAIMS로 DIA를 분석하였습니다. DDA의 경우 최근에 설치한 Proteome Disco.. 2023. 12. 29.
Real Happiness at Work (Sharon Salzberg) 도서관 구석 중고서적 판매대에서 책 제목을 보고 보고 3불에 바로 샀다. 무슨 이런 비현실적인 제목이 있을까? 회사에서 일하는것이 즐거울수 있을까? 아마 대부분 사람들은 그렇지 않을것이라고 말할것이다. 물론 자신의 일이 재미있어서 하는 사람도 많다. 하지만 월급을 받고 일하는 사람들의 대부분은 그렇지 못할것이다. 얼마전에 회사에서 오랫경험을 가진 분은 쓴 책을 읽은적이있다. 경험에서 우려나온 글이라 공감이 갔다. 그중에 기억남은것은 상사가 불의한 일을 시켜도 일단은 꾹 참고 열심히 하라는것이다. 당연한 말이다. 잘못하다가 짤리면 다른 회사로 이직하기도 어렵다. 하지만 미국인들이 적은 책들의 내용을 보면 대처방한이 사뭇다르다. HR에서 보고를 해야 한다던지 아니면 이직을 고려해야 한다고 한다. 아마 미국사.. 2023. 12. 23.