Three oocytes of C.elegans (~2700 proteins)
본문 바로가기
프로테오믹스(단백체학)

Three oocytes of C.elegans (~2700 proteins)

by Hyoungjoo 2024. 5. 25.
반응형

 

최근에 아주 재미있는 실험을 하고 있습니다. 3 개의 C.elegans oocytes 시료 분석입니다. Single oocyte는 아니고 3개의 oocyte를 합친 시료입니다.

 

 

 

 

이전에 1ngHeLa standard로 약 4000개의 단백질을 검출할 수 있습니다.

이전글

https://proteomicstechnology.tistory.com/576

 

1ngHeLa with 50 umID column-4800 proteins (DIA)

앞에 글에서 50µm ID 컬럼의 성능을 비교하는 내용이 있습니다. 50 µm vs 75 µm ID 컬럼 50 µm vs 75 µm ID 컬럼 최근 2년동안 일반적인 실험법은 대부분 최적화를 했습니다. 물론 조금더 향상을 시킬수

proteomicstechnology.tistory.com

https://proteomicstechnology.tistory.com/542

 

Low Load µPAC Neo Column, 3,300 proteins with 1ngHeLa DIA

Sing-cell Proteomics가 많이 발전하고 있는것 같습니다. 개인적으로는 아직까지 시도해볼 생각은 없습니다. 하지만 극소량의 시료를 분석할수 있는 플랫폼을 만들 필요는 있는것 같습니다. 최근에 µ

proteomicstechnology.tistory.com

https://proteomicstechnology.tistory.com/485

 

100pgHeLa 에서 1000 단백질 검출

이전 글에서 1ng HeLa에서 2000개의 단백질을 검출한 내용이 있습니다. Direct injection mode 로 1ng HeLa로 2000개 단백질 검출하기 (tistory.com) Direct injection mode 로 1ng HeLa로 2000개 단백질 검출하기 양이 매우

proteomicstechnology.tistory.com

 

 

아래는 동일한 방법으로 3개의 C.elegans oocytes를 60min LC gradient로 분석한 크로마토그램입니다

 

약 2700개의 단백질이 검출이 되었습니다. 검출이 거의 안될줄 알았는데 예상보다 많이 검출이 되었습니다.

Single oocyte에 도전을 해볼만 합니다.

 

댓글