Spectronaut 19
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프로테오믹스(단백체학)

Spectronaut 19

by Hyoungjoo 2024. 6. 21.
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이번  ASMS 기간에 Spectronaut 18이 19( SP19)버젼으로 업그레이드 되었습니다. 궁금하기도 해서 학회기간동안 호텔에서 몇가지 테스트를 해보았습니다.

 

기존  DIA 결과를  19버젼으로  분석했을때 검출수나 정량성이 향상된것을 알수 있습니다.

아래는 두개의 서로 다른 시료를 셋을 분석한 raw 파일을 각각 SP18과 SP19로 분석한 결과입니다. 19버젼에서 단백질 및 펩타이드의 수가 증가하였습니다.

 

Volcano Plot를 비교해보면  SP18에서 보이던 상당히 차이나는 단백질이 SP190에서는 보이지 않습니다.

 

 

아래는 500pg HeLa standard를 DIA로 분석한 결과에 대한 비교 있습니다. 동일한 raw 파일이지만 SP19에서 더 많은 수의 단백질과 펩타이드가 검출되었습니다. 또한 더 좋은 CV값을 가집니다. 

Spectronaut는 업그레이드 될때마다 상당한 개선이 있었습니다. 이번에도 꽤 많은 부분이 향상된것 같습니다.

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