Orbitrap Eclipse, 50ngHeLa, FAIMS DDA Method

최근에 질문이 들어온것도 있고 해서 몇가지를 공유하고자 합니다.

좋은 결과를 얻기 위해서는 분리가 잘되어야 합니다. 아래는 50ngHeLa로 분석한 크로마토그램의 예 입니다.  

1시간 분석에서  앞쪽과 뒤쪽을 빼고는 전 영역에서 펩타이드가 골고루 넓게 잘 퍼저 있습니다. 피크의 모양도 좋습니다.

 

 

FAIMS (3 CVs), OTIT, PD3.1+CHIMERYS 2.0로 검색하면 약 7,000개 단백질이 검출됩니다.  물론 최근 TimsTOF이나 Astra 장비에 비해서는 적은 숫자입니다. 또한 CHIMERYS가 아닌 SEQUEST로 검색하면 검출수는  훨씬 줄어듭니다.

 

질량분석기 파마미터는 아래를 클릭하면 다운로드 받을수 있습니다.  처음 장비를 셋팅하시는 분에게는 도움이 될것같습니다.

Eclipse_FAIMS_50ngHeLa_OTIT.pdf

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