fasta1 Canonical vs Canonical & Isoform fasta file Mouse liver 에서 단백질을 검출한후 Proteome Discover에서 MSFragger 를 사용하여 검색을 하였습니다. 2hr LC gradient에서 8,000여개의 단백질이 검출이 되어서 대박이 났구나 생각했습니다. 알고 보니 검색설정을 제대로 하지 않아서 Proteingroup로 표시되지 않았기 때문입니다. Uniprot에서 fasta file을 다운받게 되면 Canonical과 Canonical & isoform 이 보이게 됩니다. https://www.uniprot.org/help/canonical_and_isoforms 쉽게 생각해서 Isoform이 포함된 Sequence로 단백질을 검색하면 더 많은 단백질이 검출이 될것이라 예상이 됩니다. 하지만 Proteome discoverer.. 2022. 5. 14. 이전 1 다음
