FAIMS를 장착한후에는 기존에 사용하던 Spin-column high-pH fractionation를 잘 사용하지 않게 되었습니다. FAIMS의 Gas-Phase Fractionation으로도 효과있는 분획이 되기 때문입니다. 물론 HPLC장비를 이용한 분획에 비해서는 검출수가 떨어지겠지만 spin-column을 이용한 분획과 비교하면 큰 손색이 없습니다. Spin-column을 이용한 분획도 아주 쉽고 간단하지만 여전히 물리적인 분획과 시료 농축단계가 필요합니다. 하지만 FAIMS 의 GPF는 그냥 Vial에 시료를 넣고 서로 다른 CV 값에서만 분석하면 됩니다.
hpRP DDV vs Gas-Phase Fractionation DDA for Extension Library Run (Spectronaut 16) (tistory.com)
30V~80V 사이에서 각각 검출된 펩타이드의 수입니다. 40~55V사이 에서 검출수가 가장 많습니다
아래는 30V, 50V, 80V에서 검출된 펩타이드의 종류에 대한 벤다이어그램입니다. 중복되어 검출된 펩타이드도 있지만 각각의 CV값에서 특이적으로 검출된 펩타이드의 수가 훨씬 더 많습니다. 그만큼 분획의 효과가 있다는 것입니다.
아래는 Orbitrap Eclipse의 Sequence Template입니다. FAIMS의 GPF가 필요한 시료가 있으면 아래 Sequence template를 불러온 후 시작 버튼만 누르면 됩니다.
GPF를 이요한 OTOT 분석은 Specctronaut 16이후 버전에서 Extension lirary Runs로 사용할수 있습니다.
Spectronaut 17 업그레이드 (tistory.com)
Spectronaut 17 업그레이드
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