Exploris480 DIA optimization with FAIMS

이전글에도 적었지만, 이유는 잘 모르겠지만   Exploris480+FAIMS+DIA 옵션에서 예상만큼  좋은 결과를 얻지 못했습니다.  LC장비, 컬럼, 시료가 동일 합니다. 장비의 구성으로 보았을때는 Eclipse+FAIMS+DIA 결과와 차이를 보이지 않아야 되지만 실제로는 그렇지 못했습니다. 이러한 이유로  DIA분석은 항상 Eclipse장비로 수행했습니다.

 

하지만 최근에 다시 Exploris480+FAIMS 파라미터를 최적화 한후  200ngHeLa standard 로  Eclipse+FAIMS 결과(Eclipse_Optimal)와 유사한 결과를 얻었습니다(Ex480_std.). 추가로 Exploris480에서는 define m/z range 옵션이 있습니다.  한번의 cycle에서 서로 다른 isolation Window를 셋팅할수 있습니다. Eclipse도 약간의 trick을 쓰면 가능은 합니다(아니면 s/w를 업데이트 하면 이 옵션이 생길수도 있겠네요). 

 

아무튼 이 옵션을 이용해서 추가로 더 단백질과 펩타이드를 검출할수 있었습니다(Ex480_Optimal)

 

 

 

이제  Eclipse와 Exploris480에서 유사한 결과를 얻었기 때문에 DIA분석은  어느 장비를 써도 될듯합니다.