PreOmics Plasma and Serum Enrichment Kit (Enrich-iST)-Mouse

이전글에 Human Plasma에 대한 결과를 보여드렸습니다. 

 

 

PreOmics Plasma and Serum Enrichment Kit (Enrich-iST)-Human

 

• 연구소에 다양한 조건의 mouse plasma를 보유하고 있습니다. 아마 실제 연구는 Mouse 로 하지 않을까 생각합니다. 아래는 Mouse plasma에 대한 결과입니다.

• Orbitrap Eclips+Vanquish Neo (FAIMS)
• 2hr Gradient
• CoAnn nano column (HEB07502001718IWF)
• DIA
• Mouse Plasma (Neat and PreOmics enrichment)
• PreOmics Enrich-ist kit
• Spectronaut 18 

• Mouse Plasma의 경우 Enrichment kit 사용후 약 2배 이상의 단백질이 검출되었습니다. 회사 홈페이지 나와있는 비율과 유사합니다.

 

 

• Heatmap으로 보면 더 확연히 차이가 나는것을 알수 있습니다.

 

 

• 11개의 서로 다른 FAIMS CV로 Profiling 후 CHIMERYS2.0을 검색한 결과 정확히 2,000개의 단백질과 12187 펩타이드가 검출이 되었습니다. 2,000개의 mouse plasma 단백질이면 꽤 많은 숫자인것 같습니다.

• 전처리 과정이 기존의 Antibody 를 이용한것에 비해서 훨씬 빠르고 쉽습니다. 재현성있게만 나오면 앞으로의 연구에 사용할수 있을것 같습니다.