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TMT112

TMT11 시료에서 hpRP 분획과 & FAIMS Gas-Phase Fractionation 앞의 글에서 FAIMS를 이용한 Gas-Phase fractionation의 유용성 확인해보았습니다. 물리적인 분획이 필요가 없다는 장점이 있습니다. FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation (tistory.com) 이번에는 TMT 시료에 대해서 stage-tip high pH fractionation과 FAIMS의 GPF 방법에서 각각 어떤 결과가 나오는지 확인해보았습니다. 100 µg의 TMT11 시료를 11개의 hPRP로 분획하여 분석한것과 9개의 서로다른 FAIMS 값으로 분석한결과를 비교해보았습니다. 두 방법에서 모두 FAIMS를 장착하였습니다. 아래는 각각의 방법에서 얻어진 크로마토그램입니다. 아래는 각각의 방법에서 검출된 단백질과 펩타이드수입니다. 예상과는 달린 hPRP.. 2022. 8. 10.
Home-made K562+Yeast TMT11 을 Spin-column으로 분획하여 분석하기 이전글에 소개한 Human K562 와 Yeast TMT labeling 시료를 이용하여 Orbitrap Eclipse로 분석을 해보았습니다. 펩타이드 분획은 이전글에 적힌대로 Spin-column 을 이용하여 High-pH fractionation을 이용하였습니다. 관련글 Thermo사 TKO TMT11 대신 실험실에 TMT11 standard 만들기 Peptide fractionation of non-TMT and TMT mixture using C18 spin-column C18 Spin-column 분획후 Oribtrap Eclipse로 10,000 단백질 검출하기 Orbitrap Eclipse의 MS3 SPS Real-time search를 활용한 TMT 분석 (TKO TMT 11-plex st.. 2022. 5. 28.