TMT11 시료에서 hpRP 분획과 & FAIMS Gas-Phase Fractionation

앞의 글에서 FAIMS를 이용한 Gas-Phase fractionation의 유용성 확인해보았습니다. 물리적인 분획이 필요가 없다는 장점이 있습니다.

FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation (tistory.com)

 

이번에는 TMT 시료에 대해서 stage-tip high pH fractionation과 FAIMS의 GPF  방법에서 각각 어떤 결과가 나오는지 확인해보았습니다.  100 µg의 TMT11 시료를 11개의 hPRP로 분획하여 분석한것과 9개의 서로다른 FAIMS 값으로 분석한결과를 비교해보았습니다. 두 방법에서 모두 FAIMS를 장착하였습니다.

 

 

아래는 각각의 방법에서 얻어진 크로마토그램입니다.

 

 

 

 

아래는 각각의 방법에서 검출된 단백질과 펩타이드수입니다. 예상과는 달린 hPRP로 분획한것보다 FAIMS의 GPF방법에서 더 많은 펩타이드가 검출이 되었습니다.   두 방법에서 얻어진 결과를 합쳐서 검색을 해보니 단백질의 수는 크게 차이가 나지 않지만 펩타이드수에서 많은 증가가 있었습니다. 두개의 방법에서 검출되는 펩타이드의 종류가 차이가 난다는것을 알수 있습니다.  두가지의 서로 다른 분획방법을 잘 활용하면 좋을듯합니다.