FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation
본문 바로가기
프로테오믹스(단백체학)

FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation

by Hyoungjoo 2022. 7. 24.
반응형

 

FAIMS 이용한 Gas-Phase fractionation 효과는 어떨지 확인해보았습니다.   동일한 시료를 서로 다른 각각의 CV값으로  분석하는것입니다. 검출수를 증가시키기 위해서는 Stage-tip등으로  분획하는 방법이 가장 좋습니다. 하지만  시료에 따라 FASIMS gas-phase fractionation 필요할 때가 있지 않을까 생각합니다.  

 

Gas-Phase fractionation이므로 물리적인 분획과정없이 한개의 Vial 있는 시료를 여러번 분석만 하면 됩니다한번 주입시 1~2 µg정도 사용함으로 총 20 µg정도의 시료만 있으면 됩니다.

 

아래와 같이 K562 시료를 이용하여  9개의 CV값으로 각각 분석하였습니다. 비교를 위해서  3가지 CV값을 가지는 Singe run 분석과 비교해보았습니다.

 

 

 

아래는 9개의 서료 다른 CV값에서 얻어진 대한 크로마토그램입니다

 

 

아래는  각각의 방법에서 얻어진 단백질과 펩타이드의 수입니다. 예상대로 9개의 CV로 각각 분석한것에서 더 많은 수가 검출되었습니다. 펩타이드의 수를 비교해보면 거의 2배 이상이 검출이 되었습니다.

 

 

사실 이 방법에는 특별히 장점이 있지는 않습니다. 앞에서 언급했듯이 Stage-tip으로 분획후 3개의 CV값을 가지는 single method로 분석하는것이 더 나을듯합니다. 하지만 만약 분획할수 있는 여건이 되지 않을때 고려해볼수 있을 듯합니다. 혹은 시료의 양이 충분히 많고 검출수를 최대한 증가시키기 위해서 분획후 각 분획에 대해서 FAIMS Gas-phase fractionaton을 할수 있을듯합니다. 하지만 이 방법은 엄청난 시간이 소요되기 때문에 효율적이지는 않는것 같습니다.

댓글