2µg K562 에서의 단백질 및 펩타이드 검출수(Orbitrap Eclipse+FAIMS)

Reference를 데이타를 만들기 위해  2µg K562 시료에서  몇개의 단백질이 검출되는지 분석해보았습니다.   Trap-column을 장착하지 않고 Direct injection으로 분석하였습니다.

 

분석조건은 아래와 같습니다.

•Promega Human Extract (K562)

•Vanquish Neo

•Column: EasySpray (ES902)   75 µm x 25cm, 2.4µm C18

•Orbitrap Eclipse

•Direct Injection, 120min, DDA OTIT

•2µg on-column

 

아래는 3번의 분석에 해당하는 크로마토그램입니다.

Proteome Discoverer 2.5의  workflow입니다.

 

 

검출된 단백질과 펩타이드 수입니다. 

분획없이 120mim gradinet에서 약 7,000개의 단백질이 검출되었습니다.