enzyem1 ProteinProspector 를 이용한 특정 Enzyme에 대한 단백질의 예상 절단 펩타이드 확인하는 법 ProteinProspector IP 시료등 단일 표적 단백질의 분석을 진행하기 전에 반드시 거쳐야 할 과정은 적절한 enzyme 을 찾는것이다. 일단적인 단백질 동정분석에서는 trypsin이 큰 문제가 없으나 특별한 분석이 요하는 경우 trypsin이 적절치 않을때가 있다. 1) Protein N-terminal peptide의 PTM 여부 (e.g acetylation) 2)특정 염기의 PTM 여부 3)여러개의 Isoform 단백질을 구별하기 위한 특정 sequence 분석 이런 분석을 위해서는 다른 sequece 검출여부와는 상관없이 원하는 sequence를 질량분석기로 검출해야 된다. 질량분석에 원하는 영역이 적절한 길이 (8~20 염기)의 펩타이드가 생성되는지 확인할때 이 툴이 아주 유용하게 사.. 2020. 4. 9. 이전 1 다음
