Biognosys Spectronaut 16 출시 (40% 펩타이드 수 증가?)

• 이번 70th ASMS에서 Biognosys 사의 Spectronaut(SP) 15버젼이 16버젼으로 업그레이드 되었습니다.  이번 업그레이드로 이전버젼에 비해 더 많은 단백질/펩타이드를 검출할수 있게 되었습니다. ASMS 학회기간중에 업그레이드가 되어서 호텔에서 간단하게 테스트를 해보았습니다. 

 

•  이전에 검출했던 200ng HeLa 시료를 두 버젼에서 각각 분석해보았습니다. 아래와 그래프에서 보듯이 동일한 raw 파일이지만  SP16버젼에서 각각 12%, 10%의 단백질과 펩타이드의 수가 증가되었습니다.

 

•   또 하나의 아주 유용한 새로운 기능은 Library Extension runs입니다. 

• 이전 버전에서는 DirectDIA분석시 해당 protein sequence를 첨가한후 분석을 합니다.  이번 버젼에서는 DIA 검색시  기존에 분석했던 DDA raw 혹은 기존에 얻은 DIA 결과를  추가할수 있습니다.

 

• 아래와 같이 DDA raw파일을 추가할수있는 단계가 있습니다. 이때 기존에 사용했던 DDA파일 첨가하면  DIA 분석시 DDA raw 파일들을 spectra-library처럼 사용할수있습니다.  따로 DDA에 대한 Spectra-library가 필요없습니다. 아래와 같이 기존에 DDA 파일들을 첨가합니다. 

 

 

아래 그래프에서 이 기능을 사용했을때의 수의 증가를 보여줍니다.   DDA 파일을 첨가한후 상당한 수의 단백질과 펩타이드가 추가적으로 검출이 되었습니다. 단백질 및 펩타이드에서 각각 30%, 40%의 수가 증가되었습니다. 상당한 수의 증가입니다.  

• 또한 기존에 DIA분석을 했던 결과를 추가할수 있습니다.  기존에 Spectronaut로 분석했던 DIA 결과를  Spectra-library로 추가로 사용할수있습니다. 이전 분석에서 사용했던 결과를 사용할수 있으니 축적된 모든 DIA 결과를 포함시켜도 됩니다.