CHIMERYS를 Proteome Discoverer 3.0에 연동시킨후 이전 실험데이타로 간단히 테스트를 해보았습니다.
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Proteome Discoverer 3.0에 CHIMERYS 설치 완료
11월 중순인데 미시간에는 벌써 눈이 엄청오기 시작했습니다. 아이들 학교도 닫았고 저도 그냥 집에서 일을 하고 있습니다. 그 와중에 드디어 CHIMERY account를 받았습니다. 이제 두대의 workstation에
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100ng HeLa 를 이용하여 Orbitrap Eclipse (1hr LC gradient, OTIT, FAIMS) 로 분석한 결과를 몇가지 검색 엔진으로 비교해보았습니다.
아래 그래프는 검출된 단백질과 펩타이드 수에 대한 비교입니다. SEQEUST HT (INFERYS)와 비교했을때 MSPep과 CHIMERYS를 같이 연동하여 약 65% 펩타이드의 수가 증가하였습니다. CHIMERYS만으로 검색을 했을 때도 100ng Hela standard에서 약 7,000개의 단백질이 검출이 되었습니다.
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