Exploris 480 설치후 테스트 (2)-noFAIMS DIA

아무래도 가장 관심있는 분석법이 DIA입니다.  Orbitrap Eclipse에서는 FAIMS를 장착하면 검출수가 상당히 증가되었습니다.  Exploris 480에서는 어떤 경향을 보이는지 확인이 필요합니다. 먼저 FAIMS가 없는 상태에서 몇가지 실험을 하였습니다.

 

100ng HeLa standard를 이용하여 다양한 isolation window에서 분석을 하였습니다. 검출수와 더불어 data point 수를 확인하기 위함입니다.  아래는 60min와 120min LC gradient에서 각각 얻어진 결과입니다.

 

• 60min LC gradient에서 단백질/펩타이드 수 및 data point수 비교

 

 

• 120 min LC gradient에서 단백질/펩타이드 수 및 data point수 비교

 

Isolation window에 따른 단백질과 펩타이드의 수에는 큰 차이가 없지만 data piont수를 비교하면 60 min 의 경우 30 m/z, 120min의 경우 20 m/z isolation window가 적절한것 같습니다. 컬럼은 CoAnn Technology의 1.7um x 25cm 컬럼을 사용하였습니다. 아무래도 Peak의 resolution이 좋아서 그런지 충분한 data point 수를 얻기 위해서는 넓은 isolation window값이 필요한것 같습니다.