Exploris 480 설치후 테스트 (4)- FAIMS DIA

Exploris480 에서 FAIMS를 장착한후 isolation window에 따른 DIA 결과입니다. 이전글에 FAIMS가 장착하지 않았을때의 DIA 분석에 대한 테스트결과가 있습니다.

Exploris 480 설치후 테스트 (2) (tistory.com)

 

FAIMS 가 장착되면 검출수는 증가하겠지만 정량분석에 적합한 Data point수를 확보하는것이 중요합니다. 

아래 결과는 Isolation widown에 따른 단백질 및 펩타이드의 수 와 Data point 수를 보여줍니다.

 

• 100ng HeLa standard with 60min DIA (two CVs)단백질수에는 큰 변화가 없지만 Isolation window가 커질수로 펩타이드의 수는 감소됩니다. 하지만 반대로 data point수는 증가합니다.50m/z에서 평균적으로 4개의 data point 수를 가집니다. Orbitrap Eclipse에 비해서 약간 적은 수입니다. 정량분석을 하기에는 아마 적절하지 않을수도 있습니다.

 

 

• 100ng HeLa standard with 120min DIA (two CVs)
  60min에 비해서는 단백질수와 펩타이드의 수가 큰 변화가 없습니다.  Isolation window가 커질수로 펩타이드의 수는 감소됩니다. 하지만 반대로 data point수는 증가합니다. 50m/z에서 평균적으로 4개의 data point 수를 가집니다. Orbitrap Eclipse에 비해서 약간 적은 수입니다. 여전히 정량분석을 하기에는 아마 적절하지 않을수도 있습니다.