Spectronaut 18

HUPO나 ASMS 학회기간에 업그레이드된 장비나 프로그램들이 소개됩니다.

 

Spectronaut 17 업그레이드 (tistory.com)

Spectronaut 17 업그레이드

Biognosys Spectronaut 16 출시 (40% 펩타이드 수 증가?) (tistory.com)

Biognosys Spectronaut 16 출시 (40% 펩타이드 수 증가?)

 

Biognosys의 Spectronaut도 작년 HUPO와 ASMS때 16 과 17 버젼이 소개된후 이번 ASMS때 18로 업그레이드되었습니다. 그 사이에 몇번의  간단한 업그레이드가 있었지만 소숫점이 아닌 자연수가 바뀌는것은 상당한 업그레이드가 되었음을 말해줍니다.  물론 업그레이드 내용중에  본인 연구에 관련이 없는것들도 있습니다.    

 

리스트를 보니 단백질 검출수가  약 5% 이상 증가될수 있다고 하네요. 17과 18버젼을 비교해보았습니다. 동일한 raw파일을 각각 default  parameter로 검색을 하였습니다.

 

 

아래 그래프와 같이 단백질수는 약간 증가하였고 펩타이드의 수는 약간 감소하였습니다. 어떻게 해석해야 될지를 모르겠네요. 18버젼에서는  Quality가 낮은 펩타이드를 잘 구분할수 있고 또한 단백질 검출 능력이 증가된것일까요?