FAIMS Temperature optimization

FAIMS에서 펩타이드를 분리하는데 있어서 gas flow, inner & outer electronde의 온도가 중요합니다. 원리를 정확이 이해하지는 못하겠는데.. 아무튼 이 조건을 바꾸면 FAIMS 안에서 선택되어서 배출되는 펩타이드 그룹들이 달라집니다.

 

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.08.22.671812v1

FAIMS의 분리능을 약간 낮춰서 low-input 시료에 대한 감도를 증가시키는 논문입니다. 

 

메뉴얼을 찾아보니 온도와 분리능에 대한 내용이 있습니다

 

아무튼 논문에서는 Outer electronode의 온도를 100C로 고정하고 inner electronde의 온도를 standard (100C)에서 80C로 낮춰서 더 좋은 결과를 얻었습니다.

 

 

 

 

혹시나 저희 시스템에서도 효과가 있는지 확인하기 위해서 1ng HeLa로 테스트를 해보았습니다. 결과는 더 나아지는게 없네요 . 시스템도 다르고 최적화된 조건도 다르기 때문이겠지요. 더 낮은 양에서는 효과가 있을지는 모르겠습니다. 하지만 그렇게 낮은 양에서 분석할 일은 거의 없습니다.  그냥 standard 옵션을 쓰는게 좋겠습니다. 60min DIA로 1ngHeLa에서 약 5,700개 단백질이 검출되면 만족합니다.