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Spectronaut2

Spectronaut 15 의 Direct DIA 테스트 (Plasma & HeLa) 얼마전에 Spectronaut 15를 설치하였습니다. 요즘은 Spectra library 없이 direct DIA 방법을 많이 선호하는것 같습니다. 아무래도 Spectra library를 만들기 위해 소요되는 시간과 노력을 절약하기 위함인것 같습니다. 최근들어 Direct DIA에서 좋은 결과들이 나오고 있습니다. Human Plasma DIA (Q-Exactive HFX) Plasma 분석에 대한 요청이 들어온터라 이전에 분석했던 Plasma 데이타를 Spectronaut15로 분석해보았습니다. 이전에 Spectronaut14로 테스트한것과 유사합니다. Spectronaut 의 directDIA 분석과 Spectra library 기반의 정량분석 비교 Spectronaut 의 directDIA 분석과 .. 2022. 3. 1.
EnclycopeDIA와 Spectronaut 를 이용한 Human Plasma DIA 분석법 비교 Plasma 시료를 Overlap 방식을 이용한 EnclycopeDIA 프로그램방식과 non-overlap 방식으로 Spectronaunt 프로그램 방식을 분석해보았습니다. High abundant proteinds을 제거하지 않으면 검출되는 단백질의 수는 아주 제한적입니다. Plasma 시료에 대한 관련글은 아래와 같습니다. 관련글 혈액단백질 (Plasma & Serum)의 프로테오믹스 분석의 어려운점 혈액단백질 (Plasma & Serum)의 프로테오믹스 분석의 어려운점 대학원 그리고 박사후 연구원동안 혈액에서의 바이오마커를 검출하는 일을 하였습니다. 혈액은 가장 쉽게 확보할수 있는 생체시료이기에 진단용으로 아주 유용합니다. "한방울의 혈액"으로 많 proteomicstechnology.tistory.. 2021. 4. 26.