Proteomics (프로테오믹스, 단백체학)
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Intact Histone variants fractionation 몇개월전에 설치한 HPLC를 이용하여 histone Variants을 분리하고 있습니다.  아직 특별한 계획은 없지만 차후 특별한 histone variants를 분리해서 분석해야 할 일이 있을듯 합니다. 기존의 논문에서 처럼  C18컬럼으로 분리하면 Histone H1, H2, H3, H4 이 잘 분리가 되는것 같습니다.. 더 정밀하게 분리할려면 추가적인 최적화가 필요하겠지요. 아래는 대표적인 논문에 나온 크로마토그램입니다.아래는 직접 분리한 Calf histone 크로마토그램입니다. 표준 Histone과 비교해보면 논문에 나오는 경향대로 분리가 되는것 같습니다. 2024. 11. 5.
IDeA National Resource for Quantitative Proteomics Technological Advancement in MS, Data Independent Acquisition and Data Analysis - ThermoFisherhttps://www.youtube.com/watch?v=pvkedXCkHd0 2024. 9. 20.
매력 있는 팀장은 피드백이 다르다 -켄 로이드 이번주에는 책을 많이 있었네요.. 연구소에서 회의를 하다보면  대부분의 주제가  연구소의 연구발전과 효율성등을 논의합니다. 또한 서로 간의 협력도 강조합니다.  생각해보면 연구원들이 어떻게 만족하면서 연구소생활을 할지에 대해는 이야기 하지 않습니다.  1,000불 이상의 컬럼은 몇개씩 쉽게 살 수 있지만 연구원들의 학회참석에는 제한이 많습니다. 물론 예산 항목이 달라서 그런것도 있겠지요. 이 책은 조직의 성과를 높이는 격려와 보상의 피드백에 대해서 다양한 방법을 알려줍니다. 어떤 것은 개인적으로 해볼 만한것도 있지만  어떤 것은 연구소차원에서 큰 예산이 필요한것도 있습니다.  책에 나열된 내용이 비현실적인것 같지만, 저자가 구체적으로 적은것을 보면 미국의 많은 기업들이 이러한 보상을 하고 있다는 말이겠지.. 2024. 9. 3.
그들은 책 어디에 밑줄을 긋는가-도이 에이지 자신의 분야의 논문을 많이 읽다보면   어느 부분을 읽어야지 내가 필요한 정보를 얻을수 있을지 자연스럽게 알게 됩니다. 그래서 굳이 필요하지 않는 부분은 읽지 않습니다.  아마 오랫동안의 숙련으로 자연스럽게 익혀졌겠지요. 책 읽기의 능력을 한층 더 업그레이드 해줄 만한 책입니다.  책 읽기 초보자들에게도 좋겠지만 어느정도 책을 읽어온 사람이라면 바로 실천해볼만한 내용이 많습니다. 책읽기의 기술을 올리는것보다는 책읽기의 수준을 높일수 있다고 말할수 있습니다. 우리는 아는 내용에 밑줄을 치는 경우가 있습니다. 아마 자신이 아는 내용을 재 확인하는 희열이 있기 때문이겠지요. 저자는 자신의 의견과 반대 되는 내용을 밑줄을 그어라고 합니다. 이것이 책을 읽는 이유중 하나가 되기 때문입니다.  또한 어려운 책을 만.. 2024. 9. 3.
코로나 사피엔스: 최재천 외 코로나 시대를 겪으면서 얻게 된 우리 삶에 대한 조명입니다. 다양한 분야의 6명의 석학들이 인터뷰식으로 나눈 대담을 옮겨놓은 책입니다.  코로나를 기간 서로간의 관계가 단절되면서 자신을 돌아보는 기회가 많았던것 같습니다. 이전의 가치있던 일들이 그다지 중요치 않았다고 생각이 들고 반대로 일상의 하찮게 여겼던것이  중요한것으로 여겨진 경우도 많습니다. 미국에는 Panera라는 베이커리 카페가 있습니다. 코로나전 당시 9불에 커피가 한달동안 2시간 간격으로 무한 리필이 가능했습니다. 지금은 약 15불까지 올라갔지요.아무튼 저는 이곳이 저의 두번째 오피스라고 할 만큼 이곳에서 일을 많이 했습니다. 오래 앉아 있는다고 눈치도 주지 않습니다.  스타벅스처럼 갈때 마다 비싼 커피를 주문할 필요가 없지요.  출퇴근이.. 2024. 9. 1.
Useful data analysis tools (Johns Hopkins Medicine) https://www.nalab.jhmi.edu/general-8 Useful links | ProteomicsGene Ontology and/or pathway analyses DAVID : Pathway and Gene Ontology analyses Metascape : Gene Ontology and pathway analysis PANTHER : Gene Ontology analysis Webgestalt : Gene Set analysis ARACNe : Reconstruction of cellular networks WGCNA : Weighted cwww.nalab.jhmi.edu 2024. 8. 22.