Qualbrowser 에서 DIA data point 수 확인하기

Spectronaut로 검색을 하게 되면 결과값에 data point 수를 확인할수 있습니다. 하지만 정확하지는 않지만 Qualbrower에서도 대략 확인할수 있습니다. MS2 스펙트럼중에서 대락 큰 피크를 하나 골라서 Extracted Ion chromatogram(XIC) 을 만든후  피크의 수를 세어보면 됩니다

 

아래와 같이는 DIA에 얻어진 base-peak chromatogram입니다. 대략 중간쯤에서 클릭해서 MS2 피크중에 상대적으로 큰 피크를 하나 선택합니다(e.g,m/z 715.3987). 이 피크를 이용하여 MS2 스펙트럼에서 XIC 를 만듭니다. 해당 피크가 있는 피크를 확대해서 피크의 갯수를 세어보면 됩니다.

 

 유사한 m/z 값이 많기 때문에 마치 base-peak chromatogram처럼 보이게 됩니다.  해당 retention time에 해당하는 곳을 확대해서 보면 됩니다. 아래와 같이 9 points가 검출되었습니다.  펩타이드의  Abundance에 따라 data point수가 달라질수 있음으로 여러군데에서 해서 대략의 수를 확인해보면 됩니다.