이전 실험에 사용했던 시료를 FAIMS를 장착하여 분석해보았습니다.
PD2.5에서 MSFragger 와 INFERYS Rescoring 추가로 단백질/펩타이드수 증가시키기 (10,600개에서 12,000로 증가) (tistory.com)
PD2.5에서 MSFragger 와 INFERYS Rescoring 추가로 단백질/펩타이드수 증가시키기 (10,600개에서 12,000로 증
"Proteome Discoverer 2.5 에서 Sequest HT에 INFERYS Rescoring 와 더불어 MSFragger node를 추가하면 더 많은 단백질과 펩타이드를 공짜로 더 검출할수 있습니다." Human + Yeast시료를 이용하여 약 10,000개의..
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C18 Spin-column 분획후 Oribtrap Eclipse로 10,000 단백질 검출하기 (tistory.com)
C18 Spin-column 분획후 Oribtrap Eclipse로 10,000 단백질 검출하기
100 µg시료 (Human K562+Yeast)를 C18 Spin-column 이용하여 Orbitrap Eclispe에서 10,000개 단백질 검출하기 사전 분획(Pre-Fractionation)은 실험에 따라 반드시 필요한 단계입니다. HPLC장비를 이용하여 분획..
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아래 그래프는 검출된 단백질과 펩타이드의 수입니다. 동일한 조건에서 FAIMS만을 장착한후 약 2천개의 단백질을 추가적으로 더 검출하였습니다. 펩타이드의 경우 약 40,000개 이상을 추가적으로 검출하였습니다.
no-FAIMS
FAIMS (PD2.5 + MSFragger)
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