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- High-pH Reversed Fractionation 과 같이 물리적인 분획없이 FAIMS에서 서로 다른 CV값만으로 단백질의 검출수를 증가시킬수 있습니다. 단순히 단백질 검출은 특별히 의미가 없겠지만 차후 Reference Data등으로 사용할수 있습니다.
- 시료를 한개의 vial에 넣고 FAIMS의 CV값만 바꿔서 분석하면 됩니다. 하루면 데이타가 나오니 금요일쯤에 시작하면 주말동안 몇개의 서로 다른 시료에 대한 결과를 얻을수 있습니다.
- 이전에 이 방법으로 약 10,000개 이상의 단백질을 Mouse Brain에서 검출하였습니다.
https://proteomicstechnology.tistory.com/495
FAIMS 의 Gas-Phase Fraction으로 10,000개 단백질 검출 (Mouse Brain, Vanquish Neo+ Orbitrap Eclipse)
앞에서 FAIMS의 GPF에 대한 예로 Mouse Brain Tissue에 대한 결과입니다. FAIMS만으로 펩타이드 분획하기 (tistory.com) FAIMS만으로 펩타이드 분획하기 FAIMS를 장착한후에는 기존에 사용하던 Spin-column high-pH fra
proteomicstechnology.tistory.com
- 최근에는 Spleen과 Kidney에서도 해보았는데 10,000개 이상의 단백질이 검출이 되었습니다.
- OTOT로 분석한 데이타는 차후 DIA를 이용한 Spectronaut 검색시 Extension Library Runs에 유용하게 사용될수 있습니다.
Spectronaut 16의 Extension Library Runs 사용시 중요한 팁 (tistory.com)
Spectronaut 16의 Extension Library Runs 사용시 중요한 팁
Spectronaut 16 으로 DIA 분석시 Extension library run 옵션은 아주 유용한 기능중 하나입니다. 얼마전에 SDS buffers를 이용하여 추출한 시료를 DIA로 분석후 SP16으로 분석을 하였는데 생각만큼 많은 수가 검
proteomicstechnology.tistory.com
FAIMS DIA 분석에서 Spectroanut 16의 Library Extension Runs 기능 활용 (tistory.com)
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