Self-packing vs Commerical nano Columns
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프로테오믹스(단백체학)

Self-packing vs Commerical nano Columns

by Hyoungjoo 2023. 2. 24.
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저렴하게 직접 Packing 해서 사용하느냐 아니면 고가이지만 마음 편하게 상용컬럼을 사용할것인가 고민되는 분들이 계시리라 생각합니다. 예산만 충분하다면 구매를 해서 사용하는 것이 제일 편하겠지요

 

하지만 nano-column 경우 고가의 컬럼을 구매하더라도 운이 좋지 않으면 금방 막혀서 버려야 할 때가 종종 있습니다. 직접 만든 컬럼이나 구매해서 사용하는 컬럼 모두 막혀서  못쓰게 되는  경우수는 비슷할 듯 합니다.

 

이때 직접 만든 컬럼은 마음편하게 얼마든지 교체해서 사용할 수 있지만 고가의 컬럼의 경우 이러한 일이 생기면 속이 쓰립니다.   또한 어떤 때는 직접 만든 컬럼이 고가의 컬럼만큼 좋은 분리능을 보일때도 있습니다. 이럴 때는 굳이 고가의 컬럼을 사용할 필요성을 못 느끼기도 합니다.  하지만 직접 만들어 쓰는 경우 종종 분리능이 좋지 않아서 여러 번 컬럼을 교체해야 할 때가 있습니다. 이에 소모되는 시간과 에너지가 만만치 않기 때문에  그냥 구매해서 사용하고 싶어 집니다.

 

직접 컬럼을 만들어 경우 C18 사이즈가 작은것은 충전하는데 어려움이 있습니다. 특히 2.0 um이하는 backpressure 아주 높아서 충진중에 실패하는 경우가 종종 있기도 합니다.

 

가격, 편리성, 분리능 등을 고려해서 본인의 상황에 맞게 선택하면 될 것 같습니다. 최근에 개인적으로 사용하고 있는 몇가지 서로 다른 컬럼을 직접 비교해보았습니다최근에 Aurora컬럼을 사용해보았는데 분리능면에서 아주 좋은 결과를 보였습니다. 특별히 예산에 문제가 없다면 컬럼을 계속 사용하고 싶은 생각이 들었습니다.

Thermo사의 uPAC Gen2 컬럼 과 IonOpticks사의 Aurora컬럼 구매 (tistory.com)

 

이 컬럼과  CoAnn Tecnology에서 판매하는 1.7um C18 충진된 컬럼과 CoAnn Technology에서 판매하는 Self-packing 컬럼에 직접 충진한 컬럼을 같이 비교해 보았습니다.  

CoAnn Technology Self-packing column (tistory.com)

 

각각의 컬럼에 맞는 최대한 최적화한 분석방법을 사용하지 않아서 직접비교는 어렵지만 그래도 대략의 비교는 가능합니다. 아래는 대략의 단백질 및 펩타이드 검출수의 비교를 나타냅니다. Aurora 컬럼 다음으로 직접 충진한  2.4um C18 x 30cm 길이의 컬럼이 가장 많은 수의 검출 수를 보였습니다. 

 

 

이론적으로는 같은 길이라면 1.7um C18이 2.4um C18보다 더 좋은 결과를 가져야 합니다. 하지만 1.7um의 경우 2.4um C18컬럼만큼 크로마토그램이 잘 분포되지  않았습니다. 첫 피크가 상당히 늦게 용리가 되었습니다.  1.7um의 경우 고압력으로 인해 300nL/min 대신에 200nL/min을 사용한것이 하나의 이유가 될수 있습니다.  아무튼 대략의 비교이지만 앞으로 어떤 컬럼을 사용할 것인가를 결정하는데 도움이 될 듯합니다.

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