100pg HeLa std. using Thermo µPAC Neo Column (50cm)

오래전에 100pg HeLa standard를 사용하여 약 1,000개의 단백질을 검출할수 있었습니다.

100pgHeLa 에서 1000 단백질 검출 (tistory.com)

100pgHeLa 에서 1000 단백질 검출

당시만 해도 많이 검출된것이라 생각했지만 요즘 TimsTOF의 결과를 보면 1,000 단백질이 결코 많다는 생각이 들지 않습니다.

 

 

최근에 테스트를 한 µPAC Neo Column (50 cm)을 이용하여 100pg HeLa 를 분석해보았습니다.

 

이전 글에도 적었지만 µPAC Neo Column을 사용시  Emitter가 붙어있는 컬럼에 비해서 더 많은 단백질을 기대하지는 않습니다. 유사한 수의 단백질만 검출할수 있으면 좋습니다. 대신 다른 장점들이 많기 때문입니다.

 

아래는 Orbitrap Eclipse (FAIMS)를 이용하여 60min LC gardient에서  분석한  100pg HeLa standard의 크로마토그램입니다.

 

 

검출된 단백질과 펩타이드 수입니다. 이전의 결과와 유사하게 약 1,000개의 단백질이 검출이 되었습니다. 예상보다 좋은 결과입니다.

 

시료가 극미량일때는 아마 Low-Load  µPAC Neo Column (50cm)이 더 효과적일듯합니다.