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분자량이 아주 작은 단백질의 경우 Top-down 방식으로 분석이 아주 잘되는것 같습니다.
8kDa 조금 넘은 Ubiquitin의 경우 앞의 글에서 적은 방식으로 분석했을때 아주 높은 Sequence Coverage로 검출이 됩니다. Ubiquitin from bovine erythrocytes BioUltra (sigmaaldrich.com)
아래는 Obitrap Eclipse의 intact protein mode에서 EThCD로 분석한 결과입니다. Top-down 용 EasySpray column(ES907)을 이용시 약 20ng의 Uqiuitin이 사용되었습니다.
PD3.1과 ProSight4.3으로 검색후 얻어진 Sequence Coverge map입니다.
EThcD로 얻어진 MS2 matching 스펙트럼입니다.
Top-down분석을 전문적으로 하지 않을지라도 혹시 분자량이 적은 단백질을 분석해야 할 경우 Top-down 방식으로 시도해봐되 좋을듯합니다.
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