PRM으로 HeLa digestion에서 BSA 펩타이드 검출하기

시스템의 상태를 체크할때 각자 실험실 마다 다양한 방법이 있습니다. 대표적으로 BSA standard digest를 사용합니다. 또한 HeLa digestion과 같은 complex한 시료도 사용하기도 합니다.  Human cell type인 HeLa digestion에는 BSA 해당하는 펩타이드를 검출할수 있습니다. 이것을 이용하여 System suitability를 수행할수 있습니다

 

아래는 PRM을 통해  검출가능한 대표적인 BSA peptides 리스트입니다.

 

아래는 100ng Pierce  HeLa standad digest와 1ug Promega HeLa digestion에 대한 PRM 결과입니다. 위의 BSA 펩타이드가 아주 잘 검출되었습니다. 

 

 

PRM Chromatogram of BSA peptides from Pierce HeLa digest standard

PRM  Chromatogram of BSA peptides from Promega HeLa digest standard

 

 

HeLa lysate에서 BSA 펩타이드를 검출할 경우  아래와 같이 단일 BSA standard에서 얻어진 결과와 비교할수 있습니다.

 

 

HeLa 시료에 대한 PRM 결과는 다운받을수 있습니다. 다운로드

 

이러한 방법으로 QC 혹은 system suitablity에 사용할수 있습니다.