Skyline Targeted Quantitative Mass Spectrometry Course

지난 7월, 시애틀에 위치한 University of Washington에서 열린 Skyline Workshop에 참석할 기회를 가졌습니다. 그동안  Skyline의 다양한 기능을 적극적으로 활용하지는 않았습니다. DDA 기반 spectral library나 iRT 기반 분석 기능은 사용하지 않았으며, DIA 분석의 경우에도 전적으로 Spectronaut에 분석해 왔습니다.   주로 몇 개의 타겟 펩타이드를 대상으로 Synthetic peptides 기반 PRM 분석을 수행하는 데 국한되어 사용해왔습니다.

 

하지만 최근 Histone PTM 연구를 진행하면서 기존 분석 소프트웨어들이 가지고 있는 한계를 알게되어서, 부득이하게 Skyline을 사용하게 되었습니다.

 

아래는 웍샵 프로그램입니다. 사실 많은 내용들이 기존의 내용과 동일합니다. 홈페이지에서 담겨 있는  동영상의 내용과 크게 다르지 않습니다. 웍샵때 사용하는 프로그램도 웹사이트에서 찾을수 있습니다. 관심이 있는 분은 홈페이지에 들어가서 하나씩 체크해보면 실제 웍샵만큼의 효과가 있을것 같습니다.

 

 

사실 웍샵 참석의 목적은 지금 만들고 있는 프로그램에 대해서 개발자들에게 직접 물어보기 위함이 었습니다. 다행히   쉬는 시간만다 Skyline 개발자들로 부터   그동안 해결하지 못했던 문제들에 대해 직접 피드백을 받고 해결할 수 있었습니다.  이외에도 Skyline이 그 동안 많은 기능을 첨가하게 되었다는것을 알게 되었습니다.  다른 상용프로그램을 사용하지 않는 분들에게는 Skyline으로 다양한 연구를 할수 있겠다 싶었습니다.

 

씨애틀은 오래전에 한국에 있을때 학회로 왔었는데 이번엔 가족들과 같이 와서 여행도 하게 되었네요 

 

Space Needle

 

최초 스타벅스 매장