Active Background Ion Reduction Device (ABIRD)를 이용한 Background Peaks의 감소 측정

일을 시작하고 얼마후 질량분석기실에 아래 장비가 있는 걸 발견했다.

 

 

Figure 1. ABIRD

검색해서 찾아보니 ESI Source Solution LLC 사의(바로가기) ABIRD (An Active Background Ion Reduction Device, 바로가기)라는 장비였다.

 

Nano spay ESI에서의 background를 현저히 감소시키는 장비로써 N2 가스등이 필요가 없는 아주 간단한 장비이다.

Signal-to-noise 를 증가시켜 검출감도를 높이는것이라 생각된다. Air가 나오는 호스부분을 Spray tip 근처에 두고 스위치만 켜면 되다.  (ESI Source  주위에 공간이 적어서  이 장비를 세워두는게 약간 불편했. 또한 Air가 나오는 부분의 호스의 끝부분을 Spray tip 근처로 두는것도 약간 불편했다.(유사한 크기의 호스를 구해서 연장해서 연결하였다.)

 

 

아무튼 어떠한 효과가 있는지 직접 테스트 해봐았다.

 

ABIRD를 장착한 장착한것과 장착하지 않은 상태에서 2 µg HeLa를 각각 3번 반복하였다 (Figure 2)

아래 그림에서 보듯이 외형상으로는  base-peak chromatogram의 패턴은 차이가 없었다.

 

 

Figure 2. Base-peak chromatograms of 2  µg HeLa with and without ABIRD

 

다음으로 펩타이드가 용리되지 않는 영역 과 용리되어 나오는 부분에서 자세히 관찰했다.

 

먼저 펩타이드가 용리되기 전 영역 (대부분 background peaks)에서는 ABIRD로 인해 확연히 background 피크가 감소되었다.  일반적으로 검출되는 background 피크들인 m/z 371, 391, 445, 519 (왼쪽, *)이 ABIRD 를 장착했을때는 보이지 않았으며 전체 TIC 값은 약 100배 정도 감소하였다.  즉 Background peak를 감소시키는데 큰 효과가 있었다.

 

 

Figure 3. The spectrum of no peptide-elution regions with and without ABIRD

 

다음에는 펩타이드가 용리되는 부분을 관찰하였다.

 

아래 그림에서 보듯이  펩타이드가 용리되는 부분에서는 두 조건에서 특별하 차이가 없었다. 아마 펩타이드 피크들(*)의  감도가 상대적으로 높기 때문에 background 피크에 대한 효과는 적게 보이는것 같다.

 

 

 

Figure 4. The spectrum of peptide-elution regions with and without ABIRD

 

두 조건에서 얻어진 결과에 대한 DB 검색 결과이다. 아래의 그래프에서 보는것과 같이 ABIRD를 장착했을때 검출된 단백질과 펩타이드의 수가 약간 감소하였다.

 

 

Figure 5. Comparison of Protein and Peptides identified with and without  ABIRD

간단한 테스트로 결론을 내릴수는 없을것 같다. 시간이 되면 상대적으로 low amount samples로 테스트를 해봐야 될것같다. 아마 low amount samples에서는 ABIRD 장비의 효과가 증대될수도 있을 것이다.

 

이 실험을 진행한 이후 ASMS에서 업체 분을 만나서 잠시 이야기하였다.  ABIRD에서 air가 나오는 호스의 위치도 중요하다고 한다. 아마 너무 가까우면  Ion transfer tube 쪽으로 들어가는  펩타이드 양이 줄어들수있다고 들었다.