Expected LC peak Widths 의 설정값과 단백질 검출수 관계
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프로테오믹스(단백체학)

Expected LC peak Widths 의 설정값과 단백질 검출수 관계

by Hyoungjoo 2022. 3. 16.
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오래전이지만 Thermo 사의 specialist 부터 Expected LC peak Widths 값을 적절히 정해줘야 된다고 전해들었습니다.

 

 

Expected LC peak Widths AGC값을 적절히 계산하는데 사용된다고 적혀있습니다.  Peak 넓이를 예상하면 대략 피크의 바닥과 꼭지를 예측할수 있는듯합니다. 이를 이용하여 적절한 AGC 값을 계산하는가 봅니다.  하지만 모든 peak들이 일정한 피크모양을 가지는것이 아닐것이며 또한 대칭으로 나오지 않을텐데 기능이 펩타이드 혼합물에 얼마나 효율적인지는 모르겠네요.  Manual에는 10 % valley(FWTM, Full Width at 10 % maximum) 값을 사용하라고 적혀있습니다.   대략 현재 컬럼에서는 나오는 피크의 FWTM값을 확인한후 크게 3가지 값을 적용해서 분석해보았습니다. 제대로 테스트를 한것인지는 모르겠지만 아무튼 결과에는 거의 차이가 없는것 같습니다

 

 

장비에는 여러가지 기능들이 있지만 실제로 이론적인 공식처럼 그렇게  작동하지 않는것이 있는거 같습니다. 이 기능이 그냥 궁금해서 한번해보았습니다.

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