Plasma 시료를 FAIMS의 Gas-Phase Fraction로 분석해 보았습니다. 오래전이긴 하지만 Plasma 시료의 경우 stage-tip fractionation을 사용해도 검출수가 그다지 증가되지 않았던것 같습니다. FAIMS의 Gas-Phase fraction이 얼마나 효과가 있는지 궁금했습니다.
FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation (tistory.com)
TMT11 시료에서 hpRP 분획과 & FAIMS Gas-Phase Fractionation (tistory.com)
TMT11 시료에서 hpRP 분획과 & FAIMS Gas-Phase Fractionation
앞의 글에서 FAIMS를 이용한 Gas-Phase fractionation의 유용성 확인해보았습니다. 물리적인 분획이 필요가 없다는 장점이 있습니다. FAIMS를 이용한 Gas-Phase Fractionation (tistory.com) 이번에는 TMT 시료에..
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5 µL의 Mouse Plasma 를 In-solution digestion한후 0.05 µL에 해당하는 Plasma가 주입되도록 하여 분석하였습니다.
총 9개의 FAIMS CV값을 사용하여 OTOT 와 OTIT로 각각 분석했습니다.
각 CV 값에서 검출되는 단백질과 펩타이드 수의 분포도 입니다.
아래 그래프는 검출된 단백질과 펩타이드수입니다. 예상대로 OTIT에서 더 많이 검출되긴 하였지만 생각만큼 상당히 차이가 나지는 않는것 같습니다.
대략 1000개의 단백질이 검출이 되었습니다. 생각보다 많이 검출이 된것같습니다
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