CNBr digestion에 의한 Methionine 의 homoserine lactone modification

Cyno Bromide(CNBr)를 이용하여 산성 조건에서 Protein digestion시 C-terminal 쪽의 Methionine 이 homoserine lactione (hsl) ( Δm = −48 Da) 로 변형되기도 합니다. Hormoserine (-29.99 Da)이 hydrolysis를 거치게 되어 최종 -48 Da 차이가 나게 됩니다.  반면 염기성 조건에서는 free acid가 형성됩니다.

 

오래전 CNBr로 digestion된 시료를 분석하게 되었습니다. 의뢰자는 예상하는 펩타이드에 대한 정보를 주었고 검출여부를 확인하고 싶어하였습니다.  펩타이드 sequence는 다음과 같습니다. 

 

DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLM

 

 복잡한 시료가 아니기 때문에 간단히 DDA로 분석하여 해당펩타이드의 3+, 4+ 5+ 에 해당하는 m/z 1306.3074, 979.9823, 784.1873 를 찾아보았습니다. 하지만  해당 피크는 검출되지 않았습니다.

 

그러나 C-terminal 의  Methionie이 homoserine actione 로 변형되어 -48 Da이 줄어든 값인 m/z 1290.3062(3+), m/ 967.9815 (4+), m/z 774.5867(5+) 이 아래와 같이 검출이 되었습니다. 

 

 

 

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