Radio frequency (RF) Lens(%) 값에 따른 서로 다른 m/z 이온들의 감도 변화

장비의 모든 파라미터를 이해하고 실험하지는 않습니다.  결과에 특별히 영향을 주지 않으면  다른 사람들이 써오든 파라미터를 쓰게 됩니다. 하지만 특별한 분석을 할때 약간이 파마미터의 변화를 주게 되면 조금더 좋은 데이타를 얻을수 있습니다.

 

Radio frequency (RF) Lens(%)값이 있습니다.  이온들을 통과시킬때 영향을 주는 파라미터입니다. . 보통 기본값이 60%로 되어 있습니다. 

 

이 값을 변화시키면  scan 과정에서 검출되는 m/z 피크들의 상대적인 intensity가 변화게 됩니다. 

RF 값을 변화시키면  서로 다른 m/z값을 가지는 이온들의 intensity가  달라집니다. Ion transmission 의 efficiency가 약간씩 달라진다고 알고 있습니다. RF값이 증가될수록 높은 m/z값을 가지는 이온들의 intensity가 증가되는 경향이 있습니다.  기본적인 값이 50 혹은 60 % 입니다.  

 

아래 그림은 Calmix를 infusion으로 흘려주면서 서로 다른 RF Lens 에서 측정한 스펙트럼입니다. RF Lens값이 증가 될수로 높은 m/z 값을 가지는 피크들의 높이가 상대적으로 증가됨을 볼수 있습니다.

 

 

 

 

 

아래그림은  서로 다른 RF 값 (40, 50, 60, 70, 80)에서 분석한 BSA 크로마토그램입니다. Base-peak chromatogram상으로는 큰 차이가 없습니다.

 

 

하지만 각각의 피크의 intensity 보면 약간의 차이가 있습니다. 아래와 같이  동일한 시간에 용리되는 두개의 펩타이드인 mz 473.9031 와 m/z 701.3498의 상대적인 intensity가 RF Lens(%)값에 따라 달라지는것을 볼수 있습니다.  RF Lens(%)값이 증가될수록  더 큰 m/z값을 가지는 701.3498의 intensity가 증가되었습니다.

 

또 다른 예로 아래 그래프는 RF Lens(%) 값에 따라 상대적으로 높은 m/z값을 가지는 1000.8055 (3+) 의 피크의 상대적인 높이를 보여 줍니다.  위의 결과와 동일하게  RF Lens(%) 값이 증가할수록 intensity가 증가하는것을 볼수 있습니다. 

 

 

서로 다른 RF lens값에서 검출된 m/z ion들의 분포도입니다. 전반적으로 유사하지만 약간의 차이가 있습니다.

 

 

 

사실, 일반적이 실험에서는 이 RF Lens값의 변화를 사용할 필요가 없습니다.  아마 특정한 실험에서 적용가능할 듯합니다.  아래는 glycoprotein 인 Haptoglobin을 분석할 결과입니다. 3개의 서로 다른 RF lens값에서의 base-peak chromatogram 을 보여줍니다.    피크의 높낮이가 약간씩 달라집니다. 

 

 

아래는  스펙트럼은  높은 m/z값을 가지는 glycopeptide 의 상대적인 높이를 보여줍니다. RF lens값이 증가 될수록   높은 m/z 값을 가지는 glycopeptide의 피크가 다른 피크들에 비해서 증가되고 있는걸 볼수 있습니다. 현저한 차이는 보이지 않지만 상대적으로 증가된 피크는 검출결과에 좋은 영향을 줄수 있습니다.

 

 

 

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