프로테오믹스(단백체학)361 Vanquish Neo Needle seat issue 최근에 장비에서 아주 특이한 이슈가 발생하였습니다. 기존에 나오던 피크들중에 중간이후부터가 보이지 않는 현상입니다. 신기한것은 앞쪽의 피크들은 유사한 높이에서 정상적으로 나온다는것이지요. 어떻게 이것이 가능할까요? 질량분석기의 문제인지 LC 문제인지 전혀 알수가 없습니다. 보통 뒤쪽의 피크들이 잘 안나온다면 LC pump의 문제가 주원인입니다. 특히 Buffer B가 정상적으로 작동하지 않아서 Hydrophobic한 피크들이 제대로 용리되지 않기 됩니다. 이 경우에는 전체적으로 peak들의 모양이 넓어지고 RT도 변화게 됩니다. 또한 pump 압력도 정상적이지 않습니다. 하지만 이번 경우는 모든것이 정상이고 단지 뒤쪽의 피크들만 사라졌습니다. 제 인생에 처음보는 현상입니다. 질량분석기 문제라면 어떻게 선.. 2023. 3. 30. Webinar: Thermo Scientific™ uPAC™ Neo HPLC Columns On-Demand Thermo Scientific™ uPAC™ Neo HPLC Columns – Pushing Proteomics Boundaries with micro-Pillar Chromatography Thermo Scientific™ uPAC™ Neo HPLC Columns – Pushing... Though the increase in sampling depth and proteome coverage can be accomplished by rapid advances in mass spectrometer technology, appropriate selection of... theanalyticalscientist.videomarketingplatform.co 관련글 Low Load µPAC Neo Column.. 2023. 3. 28. 10K Proteins with FAIMS Gas-phase Fractionation High-pH Reversed Fractionation 과 같이 물리적인 분획없이 FAIMS에서 서로 다른 CV값만으로 단백질의 검출수를 증가시킬수 있습니다. 단순히 단백질 검출은 특별히 의미가 없겠지만 차후 Reference Data등으로 사용할수 있습니다. 시료를 한개의 vial에 넣고 FAIMS의 CV값만 바꿔서 분석하면 됩니다. 하루면 데이타가 나오니 금요일쯤에 시작하면 주말동안 몇개의 서로 다른 시료에 대한 결과를 얻을수 있습니다. 이전에 이 방법으로 약 10,000개 이상의 단백질을 Mouse Brain에서 검출하였습니다. https://proteomicstechnology.tistory.com/495 FAIMS 의 Gas-Phase Fraction으로 10,000개 단백질 검출 (Mouse .. 2023. 3. 25. TimsTOF와 DIA 작년 칸쿤에 있었던 HUPO와 이번에 US HUPO에 참가하면서 느낀점중에 하나가 바로 TimsTOF의 놀라운 점유율과 DIA의 분석법의 발전입니다. Oribtrap 장비를 신봉하는 저로써는 TimsTOF이 처음 출시되었을때 Orbitrap 에 비교되지 않을것이라고 생각했습니다. 하지만 최근 결과들과 또한 실제 사용하는 사람들을 만나서 이야기해보고 나서 생각이 많이 바뀌어었습니다. 특히 TimsTOF의 특징으로 인해 짧은 Gradient time에서도 충분한 Peak당 Data-point를 가질뿐만 아니라 단백질 검출도 상당히 높다는것입니다. 아마 업체에 이 부분을 많이 강조하는것 같습니다. 특히 시료수가 많은 실험실에서는 이 점이 아주 유용하리라 생각합니다. 사실 Orbitrap Eclipse에 FAI.. 2023. 3. 17. 2023 US HUPO (Chicago) 2023 US HUPO 참석으로 시카고로 왔습니다. 최근 눈 수술을 해서 비행기는 타지 못하고 기차를 타고 왔습니다. 다행히 시키고까지 멀지 않아서 4시간만에 도착했습니다. 작년에 영사업무나 한인 마트때문에 시카고에 몇 번 오긴 했지만 학회가 열리는 다운타운 쪽은 처음인 것 같습니다. 지금 사는 곳은 작은 도시라서 그런지 시카고 다운타운은 아주 크게 느껴집니다. 이전에 살던 필라델피아의 다운타운과도 또 다른 느낌이 있습니다. 2023. 3. 5. Self-packing vs Commerical nano Columns 저렴하게 직접 Packing을 해서 사용하느냐 아니면 고가이지만 마음 편하게 상용컬럼을 사용할것인가 고민되는 분들이 계시리라 생각합니다. 예산만 충분하다면 구매를 해서 사용하는 것이 제일 편하겠지요 하지만 nano-column의 경우 고가의 컬럼을 구매하더라도 운이 좋지 않으면 금방 막혀서 버려야 할 때가 종종 있습니다. 직접 만든 컬럼이나 구매해서 사용하는 컬럼 모두 막혀서 못쓰게 되는 경우수는 비슷할 듯 합니다. 이때 직접 만든 컬럼은 마음편하게 얼마든지 교체해서 사용할 수 있지만 고가의 컬럼의 경우 이러한 일이 생기면 속이 쓰립니다. 또한 어떤 때는 직접 만든 컬럼이 고가의 컬럼만큼 좋은 분리능을 보일때도 있습니다. 이럴 때는 굳이 고가의 컬럼을 사용할 필요성을 못 느끼기도 합니다. 하지만 직접 만.. 2023. 2. 24. 이전 1 ··· 8 9 10 11 12 13 14 ··· 61 다음
