분류 전체보기537 Battle Human vs OT-2 Digestion Opentros의 OT-2를 셋팅중에 있습니다. 자동화 장치에 대해서는 별로 좋은 기억이 없어서 큰 기대를 하고 있지는 않습니다. 사실 적은 수의 시료의 경우 사람의 손이 더 빠르고 정확할수 있습니다. 자동화장치는 셋팅하는것도 번거롭고 언제 에러가 생길지 알수 없습니다. 그래도 최근에서 기술력이 좋아져서 기대를 하고 있습니다. 연구소에 왔을때 사용하고 있지 않는 두 대의 OT-2중 한개를 받았습니다. Python 기반으로 프로그램을 만들어야 하는 번거로움때문에 사용하고 있지 않았습니다. 그리고 각 실험마다 자세한 프로그램 셋팅이 필요하기 때문에, 수작업에 익숙한 사람들에게는 그다지 매력적이지 않았습니다. 아무튼 차후 프로테오믹스 실험에 적용해보기 위해서 간단한 실험부터 시작했습니다. 현재 cell ext.. 2024. 4. 9. The One Thing - Gary Keller, Jay Papasan 이전에 읽은책인데 다시 읽게 되었습니다. 대학원때는 한번에 여러가지 프로젝트를 하곤 했습니다. 또한 하루에도 시간을 나누어서 여러가지 일들을 했었습니다. 시료를 준비하고 반응하는 동안에 할 수 있는 다른 작은 일들을 하고 했었습니다. 시간을 최대한 효율적으로 쓴다는 이유였습니다. 나름대로 잘한다고 생각을 했었지요. 아마 많은 학생들이 그렇게 하지 않았을까 생각합니다. 그런 버릇이 있어서 그런지 한번에 한가지만 하는것이 익숙치 않습니다. 뭔가를 하고 기다리는 시간이 아깝게 느껴집니다. 대부분의 일들이 한국에 비해서 천천히 진행되는 여기서는 하지 않아도 될 Multitasking에 대한 욕망이 올라옵니다. 쉬는 시간이 아깝게 느껴지기 때문이지요. Multitasking이 실제로 효율적이지 않다는것이 다 알고.. 2024. 3. 30. Proteome Discoverer Workshop : Data processing with CHIMERYS search engine PD+CHIMERYS Worskhop 2024. 3. 27. 파일사이즈로 시스템상태 체크하기 파일사이즈로 시스템의 상태를 어느정도 체크할수 있습니다. QC 시료의 파일일 사이즈가 점점 줄어든다면 뭔가 이상이 있습니다. 아래는 일련의 QC 크로마토그램입니다. 언뜻보기에는 정상처럼보입니다. 하지만 첫번째에서 5번째까지 파일사이즈가 시간이 지남에 따라 점정 줄어드는것을 알수 있습니다. 다시 크로마토그램으로 돌아가보면 크로마토그램의 뒤쪽부분 부분의 피크의 높이가 약간씩 줄어든것을 알수있습니다. 특히 5번째 크로마토그램에서 확연히 보입니다. 시스템을 다시 점검후에는 문제를 해결후에 아래와 같이 6번째 파일 사이즈의 크기가 다시 커졌습니다. 아래는 실제 연구 시료의 크로마토그램입니다 QC시료에서 보여졌던 문제가 실제 시료에서도 나타났습니다. QC 시료의 파일사이즈를 확인하지 않았다면 계속 실험이 진행되었을.. 2024. 3. 26. CoAnn Technology nano-column (HEB07502001718IWF) 프로테오믹스를 하고 있는 사람이라면 펩타이드에 분리에 사용되는 컬럼에 관심이 많습니다. 더 좋은 성능이 가진 컬럼을 사용하고 싶은 욕망이 있지요. 논문이라 학회에서 보여지는 아주 멋진 크로마토그램을 갖고 싶어합니다. 하지만 실험실의 예산에 따라 사용할수 있는 컬럼이 제한되는 경우가 많습니다. 이전글 Self-packing vs Commerical nano Columns (tistory.com) Thermo사의 uPAC Gen2 컬럼 과 IonOpticks사의 Aurora컬럼 구매 (tistory.com) 저희는 이 컬럼을 사용합니다. 뒤에 WF가 붙으면 Metal union이 연결된 컬럼입니다. HEB07502001718IWF - CoAnn Technologies Union이 있는것과 없는것에 가격에 큰.. 2024. 3. 22. PreOmics Plasma and Serum Enrichment Kit (Enrich-iST)-Mouse 이전글에 Human Plasma에 대한 결과를 보여드렸습니다. PreOmics Plasma and Serum Enrichment Kit (Enrich-iST)-Human 연구소에 다양한 조건의 mouse plasma를 보유하고 있습니다. 아마 실제 연구는 Mouse 로 하지 않을까 생각합니다. 아래는 Mouse plasma에 대한 결과입니다. Orbitrap Eclips+Vanquish Neo (FAIMS) 2hr Gradient CoAnn nano column (HEB07502001718IWF) DIA Mouse Plasma (Neat and PreOmics enrichment) PreOmics Enrich-ist kit Spectronaut 18 Mouse Plasma의 경우 Enrichment ki.. 2024. 3. 22. 이전 1 2 3 4 5 6 7 8 ··· 90 다음
