[Biognosys spectronaut] Configure condition 설정

Spectonaunt 메뉴얼에 보면 Experimental Setting시 각각의  run에 대해서 condition, biological replications, fractionation을 설정하도록 되어있습니다. 이것은 시료의 그룹별로 적절히 정량분석하기 위함인것 같습니다. 물론 Spectronaut는 fractionation후 수행하는 DIA 는 추천하지 않습니다. 

 

 

각각의 조건에 따라 동일한 그룹에 대해서 동일한 색깔로 자동 표시가 됩니다.

 

앞에 글에서 수행했던 데이타를 이용하여  Grouping을 하지 않았을때와 했을때 정량값에 대한 차이가 있는지 확인해 보았습니다. 아래와 같이 동일한 양의 HeLa에 서로 다른 양의 ovalbumin 을 spiking 한 시료를 반복 주입한 데이타 입니다.

 

얻어진 결과를 export 하여 그래프로 만들었습니다. 얻어진 Ovalbumin 의 상대적인 값은 아래와 같습니다.

그래프 상으로는 큰 차이가 없는것 같습니다. 거의 동일하게 나왔습니다.

 

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