최근에 분석한 rat brain tissue DIA 결과를 이용하여 Gas-Phase Fraction(EnclycopeDIA), directDIA(Spectronaut), Spectra-library(Spectronaut)을 비교했습니다. 이전에 동일한 비교를 하였지만 다른 시료형태에서는 어떤 결과가 나오는지 확인이 필요하였습니다.
EnclycopeDIA방법에서 사용한 overlapp DIA로 시료를 분석하여 3가지 분석방법으로 데이타를 분석하였습니다. Rat Proteome의 Spectra library는 Spectronaut에서 제공하는 것을 사용하였습니다.
6개의 시료를 이용한 결과는 아래와 같습니다. 이전의 결과와는 다르게 Spectra library를 이용한 Spectronaut에서 가장 많은 단백질이 검출되었습니다. 하지만 펩타이드는 수는 DirectDIA 에서 가장 높았습니다.
아마 여러 요인(시료의 특성, Spectra-library quality) 에 따라 3 가지 방법의 우열이 가려지는듯 합니다. 아직까지는 어떤 방법이 더 좋다고 말하기는 어려울것 같습니다.
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