Biognosys 의 Spectronaut Pulsar 프로그램을 이용한 Spectra library 만들기

DIA 분석을 위해서는 Spectra library가 필요합니다. 보통 장비회사에서 사용하는 프로그램을 이용하여 Profiling한 output를 이용하여 생성합니다. Biognosys 사의 Spectronaunt Pular 프로그램도 raw 파일을 이용하여 database를 수행한여 Spectra library를 만들수 있습니다. raw파일과 해당 Fasta파일만 있으면 됩니다.

 

• Spectronanunt  프로그램을 열면 아래 왼쪽과 같이 Pulsar 을 이용하여 Library 를 만들수 있는 옵션이 있습니다.
• 여기를 클릭한후 해당 raw 파일들을 불러옵니다.
• 저장한  Library의 이름을 적습니다(예, HeLa_Pulsa_Library)

 

 

 

• 해당 fasta 파일을 선택합니다.
• 선택후 아래 오른쪽 그림과 같이 적용이 되었습니다.

 

 

 

 

 

• 일반 프로그램과 동일하게 펩타이드 검출을 위한  파라미터를 선정합니다. Factory setting 을 선택해보았습니다.
•  

 

 

• 검색에 필요한 Fasta 외에 fasta를 추가 할수 있습니다. 여기서는 선택하지 않았습니다.
• GO 검색을 위한 DB 를 선택할 수있습니다.
• 기존에 있는 library를 추가로 삽입할 수 있습니다. Spectra library의 수를 증대시키는 효과가 있습니다. 하지만 여기서는 선택하지 않았습니다.

 

• 최종적으로 Summary 를 보여줍니다.

 

• Finish를 누르면 진행됩니다.
• 완료가 되면 아래와 같이  Spectra library가 생성되었습니다. 차후 DIA  분석시 이 library 를 선택하면 됩니다.

 

 

 

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